О научном издательстве ►
  • О журнале
  • Индексирование
  • Редакционная коллегия
  • Цели и задачи
  • Соответствие стандарту I4OC
  • Архивация и депонирование

Восточно Европейский Научный Журнал

  • Главная
  • Авторам
    • От главного редактора
    • Оформление научной статьи
    • Этика научных публикаций
    • Политика открытого доступа
    • Образец научной статьи
    • Анкета автора
    • Редакционный сбор
    • Рецензирование статей
  • Редакционный сбор
  • Архив журнала
  • Сроки и условия
    • Договор оферты
    • Политика доставки и возврата
    • Политика конфиденциальности
  • Контакты
  • Языки
    • Ukrainian
    • Polish
    • Russian
◄ Меню сайта
Анкетаавтора
  • Главная
  • Журналы
  • Медицинские науки
  • CLONING A SEQUENCE OF SMALL HARPIN RNA DIRECTED TO HUMAN GELATINASE B INTO THE EXPRESSION VECTOR pGPV-17019250

CLONING A SEQUENCE OF SMALL HARPIN RNA DIRECTED TO HUMAN GELATINASE B INTO THE EXPRESSION VECTOR pGPV-17019250

Подать статью в SCOPUS

CLONING A SEQUENCE OF SMALL HARPIN RNA DIRECTED TO HUMAN GELATINASE B INTO THE EXPRESSION VECTOR pGPV-17019250

Архив в PDF формате
Дата публикации статьи в журнале:
Название журнала: Восточно Европейский Научный Журнал, Выпуск: , Том: , Страницы в выпуске: -
Автор: Mogulevtseva J.A. Bachelor of Science Russian State Agrarian University – Moscow Timiryazev Agricultural Academy MezentsevA.V. Doctor of Philosophy N.I. Vavilov Russian Institute of General Genetics – IOGen RAS
, ,
Анотация: Summary. INTRODUCTION: Matrix metalloproteinases are a group of zinc-containing calcium-dependent endopeptidases that play a crucial role in the pathogenesis of hyperproliferative disorders, such as psoriasis. In psoriasis, matrix metalloproteinases contribute to epidermal remodeling due to their ability to modify the compo- sition of the extracellular matrix and modulate the intercellular contacts. They also regulate the penetration of dermal microcapillaries by immune cells. AIM of this study was to create a vector that would express small hairpin RNA (shRNA) specific to human gelatinase B and suppress its expression in cultured epidermal keratinocytes. METHODS: shRNA specific to gelatinase B was designed using “RNAi-designer” online tool. The sequence encoding shRNA was cloned into the vector pGPV-17019250 using commercial T4 DNA-ligase and restriction endonucleases BamH1 and EcoRI. The integrity of the obtained expression vector pGPV-17019250-GB was con- firmed by PCR amplification and DNA sequencing with vector-specific primers. RESULTS: In this study, we selected а DNA sequence that encodes shRNA specific to human gelatinase B. We also synthesized and cloned the named sequence into the expression vector pGPV-17019250. In addition, we confirmed that the selected DNA sequence was properly cloned into the vector.
Ключевые слова: Key words: psoriasis, gelatinase B, molecular cloning, expression vector, shRNA, gene silencing.  
Данные для цитирования: Mogulevtseva J.A. Bachelor of Science Russian State Agrarian University – Moscow Timiryazev Agricultural Academy MezentsevA.V. Doctor of Philosophy N.I. Vavilov Russian Institute of General Genetics – IOGen RAS, . CLONING A SEQUENCE OF SMALL HARPIN RNA DIRECTED TO HUMAN GELATINASE B INTO THE EXPRESSION VECTOR pGPV-17019250. Восточно Европейский Научный Журнал. Медицинские науки. ; ():-.



Список литературы: References 1. Parisi R., Symmons D.P., Griffiths C.E. and Ashcroft D.M. Global epidemiology of psoriasis: a systematic review of incidence and prevalence. J. Invest. Dermatol. 2013. 133(2):p. 377-385. 2. Znamenskaya L.F., Melehina L.E., Bogdanova E.V. and Mineeva A.A. Prevalence and distribution of psoriasis in Russian Federation. Vestn. Dermatol. Venerol. (5):p. 20-29. 3. Mezentsev, A., A. Nikolaev, and S. Bruskin, Matrix metalloproteinases and their role in psoriasis. Gene, 2014. 540(1): p. 1-10. 4. Starodubtseva N.L, Sobolev V.V., Soboleva A.G., Nikolaev A.A. and Bruskin S.A. Expression of genes for metalloproteinases (MMP-1, MMP-2, MMP- 9, and MMP-12) associated with psoriasis. Genetika. 2011. 47(9):p. 1254-1261. 5. Database "NCBI Nucleotide", http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ (accessed at Jan 3, 2019). 6. Ren Y, Gong W., Zhou H., Wang Y., Xiao F. and Li T. siRecords: a database of mammalian RNAi experiments and efficacies. Nucleic Acids Res. 2009. 37(Database issue): D146-149. 7. Online Application "blastn suite", https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE =BlastSearch (accessed at Jan 3, 2019). 8. Kibbe W.A. OligoCalc: an online oligonucleotide properties calculator. Nucleic Acids Res. 2007. 35(Web Server issue): W43-6. 9. Vogelstein B. and Gillespie D. Preparative and analytical purification of DNA from agarose. Proc Natl Acad Sci U S A. 1979. 76(2): p. 615-619. 10. Huff J.P., Grant B.J., Penning C.A., Sullivan K.F. Optimization of routine transformation of Escherichia coli with plasmid DNA. Biotechniques. 1990. 9(5):p. 570-572, 574, 576-577. 11. Rueden C.T., Schindelin J., Hiner M.C., DeZonia B.E., Walter A.E., Arena E.T., Eliceiri K.W. ImageJ2: ImageJ for the next generation of scientific image data, BMC Bioinformatics 2017. 18:p. 529. 12. Online Application "RNAi designer", http://bioinfo.clontech.com/rnaidesigner/frontpage.jsp (accessed at Jan 3, 2019). 13. Glazewska E.K., Niczyporuk M., Lawicki S., Szmitkowski M., Zajkowska M., Donejko M., Przylipiak A. ROC analysis of selected matrix metalloproteinases (MMPs) and tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs) in psoriatic patients. Postepy Dermatol. Alergol. 2018. 35(2):p. 167-173. 14. Gearing A.J., Beckett P., Christodoulou M., Churchill M., Clements J., Davidson A.H., Drummond A.H., Galloway W.A., Gilbert R., Gordon J.L, Processing of tumour necrosis factor-alpha precursor by metalloproteinases. Nature. 1994. 370(6490):p. 555-557. 15. Boese Q., Leake D., Reynolds A., Read S., Scaringe S.A., Marshall W.S. and Khvorova A. Mechanistic insights aid computational short interfering RNA design. Methods Enzymol, 2005. 392: p. 73-96. 16. Turner N.A., Hall K.T., Ball S.G. and Porter K.E. Selective gene silencing of either MMP-2 or MMP-9 inhibits invasion of human saphenous vein smooth muscle cells. Atherosclerosis. 2007. 193(1):p. 36-43. 17. Gondi C.S., Lakka S.S., Dinh D.H., Olivero W.C., Gujrati M. and Rao J.S. Downregulation of uPA, uPAR and MMP-9 using small, interfering, hairpin RNA (siRNA) inhibits glioma cell invasion, angiogenesis and tumor growth. Neuron Glia Biol. 2004. 1(2):p. 165-176. 18. Sancéau J, Truchet S, Bauvois B. Matrix metalloproteinase-9 silencing by RNA interference triggers the migratory-adhesive switch in Ewing's sarcoma cells. J. Biol. Chem. 2003. 278(38):p. 36537- 36546. 19. Brule S., Charnaux N., Sutton A., Ledoux D., Chaigneau T., Saffar L. and Gattegno L. The shedding of syndecan-4 and syndecan-1 from HeLa cells and human primary macrophages is accelerated by SDF- 1/CXCL12 and mediated by the matrix metalloproteinase-9. Glycobiology. 2006. 16(6):p. 488-501. 20. Meyer E., Vollmer J.Y., Bovey R. and Stamenkovic I. Matrix metalloproteinases 9 and 10 inhibit protein kinase C-potentiated, p53-mediated apoptosis. Cancer Res. 2005. 65(10):p. 4261-4272. 21. Hu M., Peluffo G., Chen H., Gelman R., Schnitt S. and Polyak K. Role of COX-2 in epithelial- stromal cell interactions and progression of ductal carcinoma in situ of the breast. Proc. Natl. Acad. Sci U S A. 2009. 106(9):p. 3372-3377. 22. Mogulevtseva J.A. and Mezentsev A.V. Cloning of the sequence encoding small interfering RNA directed to human matrix metalloproteinase 1 into the expression vector pGPV-17019250. Wschodnioeuropejskie Czasopismo Naukowe. 2016. 9(1):p. 85-93 23. Kuhn, H. and Frank-Kamenetskii M.D. Template-independent ligation of single-stranded DNA by T4 DNA ligase. FEBS J. 2005. 272(23): p. 5991- 6000.


ISSN: 2782-1994
DOI: 10.31618/EESA.2782-1994

ICI Journal Master List 2019
ICV 2019: 64.33

Журнал имеет Импакт Фактор (Impact Factor)

Для авторов

заполнить анкету автора
оплатить ред. сбор

Поиск по изданию

Все Начиная с 2016 г.
Статистика цитирования 1307 1274
h-индекс 14 13
i10-индекс 22 19

Цитируемость научных публикаций согласно GOOGLE SCHOLAR

НАУЧНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ

  • Archiwum czasopisma
  • Архитектура
  • Без рубрики
  • Биологические науки
  • Ветеринарные науки
  • Военные науки
  • Географические науки
  • Геологические науки
  • Журналы
  • Искусствоведение
  • Исторические науки
  • Культурология
  • Медицинские науки
  • Науки о Земле
  • Научные новости Польши
  • Научные новости России
  • Педагогические науки
  • Политические науки
  • Психологические науки
  • Сельскохозяйственные науки
  • Социологические науки
  • Технические науки
  • Фармацевтические науки
  • Физико-математические науки
  • Филологические науки
  • Философские науки
  • Химические науки
  • Экономические науки
  • Юридические науки

Поиск по сайту

Подписка (введите свой Email)

  • Главная
  • Авторам
    • От главного редактора
    • Оформление научной статьи
    • Этика научных публикаций
    • Политика открытого доступа
    • Образец научной статьи
    • Анкета автора
    • Редакционный сбор
    • Рецензирование статей
  • Редакционный сбор
  • Архив журнала
  • Сроки и условия
    • Договор оферты
    • Политика доставки и возврата
    • Политика конфиденциальности
  • Контакты
  • Языки
    • Ukrainian
    • Polish
    • Russian
Восточно Европейский Научный Журнал

@2022. All rights reserved.

Администрация сайта не несет никакой ответственности за точность содержания информации опубликованной на сайте, а так же за любые рекомендации или мнения, которые могут содержаться в исследовательских публикациях, и за применимость её к конкретным лицам, по причине субъективности результатов авторских исследований. Кроме того, поскольку интернет не обеспечивает в полной мере надежной защиты информации, Сайт не несет ответственности за информацию, присылаемую через интернет.
TOP
404: Not Found